Пищугин Дмитрий Юрьевич — начальник федерального государственного казенного учреждения; главный государственный санитарный врач;
299028, Севастополь, ул. Древняя, д. 40
Dmitry Yu. Pishchugin — Head of the; Chief State SanitaryDoctor
299028, Sevastopol, 40 Drevnaya str
Тарумов Роман Алексеевич — кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник 13 отдела федерального государственного бюджетного учреждения
195043, Санкт-Петербург, Лесопарковая ул., д. 4
Roman A. Tarumov — Senior Researcher, Candidate of Medical Sciences;
195043, St. Petersburg, st. Lesoparkovaya 4
Шубенкин Сергей Геннадиевич — начальник отдела (микробиологического) федерального государственного казенного учреждения
299028, Севастополь, ул. Древняя, д. 40
Sergey G. Shubenkin — Head of the Department (Microbiological)
299028, Sevastopol, 40 Drevnaya str
Шеменева Анна Николаевна — старший врач-эксперт отдела (государственного санитарно-эпидемиологического надзорарайона ответственности) федерального государственного казенного учреждения
299028, Севастополь, ул. Древняя, д. 40
Anna N. Shemeneva — Senior medical expert of the Department (State Sanitary and Epidemiological supervision of the area ofresponsibility)
299028, Sevastopol, 40 Drevnaya str.
Цинцадзе Отари Григорьевич — кандидат медицинских наук, заведующий отделением особо опасных инфекций отдела(микробиологического) федерального государственного казенного учреждения
299028, Севастополь, ул. Древняя, д. 40
Otari G. Tsintsadze — Cand. of Sci. (Med.), Head of the Department of Especially Dangerous Infections of the Department (Microbiological)
299028, Sevastopol, 40 Drevnaya str.
Охотская Людмила Леонидовна — врач-бактериолог отдела (микробиологического) федерального государственного казенного учреждения
299028, Севастополь, ул. Древняя, д. 40
Lyudmila L. Okhotskaya — bacteriologist of the Department (Microbiological)
299028, Sevastopol, 40 Drevnaya str.
ЦЕЛЬ: Оценка возможности использования аппаратных технологий, имеющихся на снабжении Вооруженных сил России, для проведения массового оперативного скрининга военнослужащих на наличие РНК вируса SARSCoV-2 методом ПЦР по «конечной точке» в полевых условиях.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ: Была использована ПЦР по «конечной точке» по протоколу выявления РНК вируса комплектом тест-системы ПЦР-РВ «Поливир SARS-CoV-2» с реагентом выделения «РНК-экспресс» совместного производства ООО НПФ «Литех» и Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины ФМБА. Биоматериалом для исследования явились 157 образцов назофарингеальных мазков, отобранных у лиц с клинической симптоматикой респираторного заболевания и контактных по COVID-19. Статистика. Полученные в ходе экспериментальных исследований данные подвергали стандартной статистической обработке в программе «Statistica 6,0». Для оценки значимости различия частот наблюдения изучаемого признака в независимы группах использовали непараметрический критерий Пирсона хи-квадрат (c2). Вероятность p≤0,05 и выше считали достаточной для вывода о статистической значимости различий полученных данных.
РЕЗУЛЬТАТЫ: Установлено, что из 157 проб биоматериала, оцененных на содержание генетических маркеров вируса SARS-CoV-2 методом ПЦР по «конечной точке» и методом ПЦР «Real time», 141 и 146 проб, соответственно, оказались положительными. При этом статистически значимых отличий между полученными данными в указанных методах обнаружено не было (c2=1,013, р=0,31).
ОБСУЖДЕНИЕ: Показано, что сравнительная характеристика изученных методов лабораторной диагностики вируса SARS-СоV-2 предположила возможность детекции специфического участка генома вируса по технологии ПЦР «конечная точка» с использованием расходных реактивов, предназначенных для метода ПЦР «Real time».
OBJECTIVE: the assessment of potential benefits of implementing hardware technologies, available for supply in the Russian Armed Forces to hold mass rapid screening test of servicemen for RNA virus SARS-CoV-2 by PCR on «endpoint» in field conditions.
MATERIALS AND METHODS: PCR on «endpoint» was applied according to the protocol of RNA virus detection by the set of test system PCR-RV «PolivirSARS-CoV-2» with extraction reagent «RNA-express», joint production of LLC NPF «Litech» and the Federal Research and Clinical Centre of Physical-Chemical Medicine FMBA. The biomaterial for the research was 157 samples of nasal-pharyngeal smears, taken from patients with clinical symptoms of respiratory disease who had contacts with COVID-19. Statistics. The data received from pilot studies had standard statistical processing in the program «Statistica 6,0». Non-parametric Pearson’s chi-square (c2) criteria was used to assess the significance of different observation frequencies of the studied feature in independent groups. Probability p≤0,05 and higher was considered sufficient to conclude statistical importance of the differences received.
RESULTS: It is stated that out of 157 biomaterial samples, assessed for the content of SARS-CoV-2 virus’s genetic markers by PCR on «endpoint» and PCR «Realtime», 141 and 146 samples, respectively, turned out to be positive. In addition, there were no statistically important differences between the received data in these methods (c2=1,013, р=0,31).
DISCUSSION: It is shown that comparative characteristics of the studied methods in laboratory SARS-Соv-2 virus diagnostics suggested the possibility of detecting specific segment of the virus genome by PCR «endpoint» technology, using expendable reagents, made for PCR «Realtime».
The authors declare that there are no conflicts of interest present.